全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。在文明遭到毁灭的石头世界里，千空集结新伙伴的力量一起建立“科学王国”，最终目标是用科学的力量复原整个世界。但是，由灵长类最强的高中生…
作为最底层职业【鉴定士】出生的艾因一直过着最底层的生活。在一次冒险中，遭遇大量地狱猎犬，同伴为了活命而把艾因当做了诱饵。本因就这么结束生命的艾因遇到了她，从此艾因的命运发生了巨大的变化。
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“为什么谁都不记得真正的世界呢……！”本是争夺地上霸权的五种族大战以英雄希德率领的人类胜利告终的时代；但是这个世界，在少年凯眼前突然被「改写」了。在被改写的世界里，凯所看到的是，由于英雄希德不存在，人类在五种族大战中败北…