世界受“魔甲虫”威胁，大地遭其占据，人类如今只能住在天空中的浮游都市里。人类当中诞生出以魔力对抗“魔甲虫”的魔法师——空战魔导士。就读空战魔导士培育机构——学园浮游都市“密斯特岗”的彼方·英司，是被冠上“黑之剑圣”称…
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平凡的少女叶波柚香，某天在回家的路上看见了一只神秘生物「米咚」，并被告知自己具有魔法少女的素质。柚香心中虽然有些犹豫，但还是决定接受腕轮，成为一名魔法少女。没想到变身的服装居然是泳装！？米咚更是不时对她作出性骚扰行为…
平凡的高中生须藤要，收到了一封从未听说过的App「达尔文游戏」发来的邮件。将App启动的要，被卷入了一场玩家之间驱使异能战斗的游戏。在不明就里的情形之下，面对袭来的强力玩家，要能否在与他们的对战中制胜，并活到最后呢！？